Personnellement, j'estime qu'un prologue doit juste servir à situer le lecteur dans l'espace et dans le temps, ou a comprendre pourquoi les personnages vont se comporter de telle ou telle manière dans le roman. Ici, on est sur des personnages qui vont agir de manière différente selon qu'ils appartiennent à la société qui a régressé ou à celle qui a suivi l'évolution. La seule base qu'ils ont en commun, c'est qu'ils ont vécu une catastrophe des siècles plus tôt.
Je pense que c'est donc cette catastrophe qui doit servir de prologue, au cas où tu en écris un.
Si je devais écrire un roman dans le même genre, je pense que je partirais par exemple sur cette idée :
- prologue: catastrophe climatique, guerre nucléaire, chute d'astéroïde, ou n'importe quoi d'autre...
- roman en lui même : les chapitres sont consacrés à la vie de l'héroïne dans son monde à l'âge de pierre, mais chaque dernier paragraphe est consacré à la vie d'une femme qui a des ancêtres en commun avec l'héroïne, qui lui ressemble comme deux gouttes d'eau, mais qui vit dans le mondé évolué.
Ainsi le lecteur comprend dès le départ, qu'il y a deux sociétés qui vivent en parallèle sur une même planète en s'ignorant.
Il faut savoir que cela n'a rien d'extraordinaire : jusque dans les années 50, on a découvert des tribus au fin fond de l'Amazonie qui vivaient encore à l'âge de pierre. Et en Nouvelle-Calédonie, qui n'est pourtant pas immense et qui est un territoire français, c'était aussi le cas pour certaines tribus kanaks jusque dans les années 90.